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CVPR18录用论文利用量化提升医疗影像

时间:2019-08-16 19:58:03 来源:互联网 阅读:0次

  CVPR 18录用论文:利用量化提升医疗影像分割的准确度

  (公众号:) AI 科技评论按:本文作者为圣母大学(University of Notre Dame)博士后徐小维,他为 AI 科技评论撰写了基于 CVPR 录用论文《Quantization of Fully Convolutional Networks for Accurate Biomedical Image Segmentation》的解读稿件,未经许可不得转载。

  来自美国圣母大学和华中科技大学的研究者们提出了一种利用络量化提升用于医疗影像分割的深度学习模型精度的优化方法。该方法创新性地将旨在压缩络模型的量化方法应用到医疗影像分割深度学习模型中,相比于已有的方法,针对当前流行的 Gland 数据集可提升当前 state-of-the-art 的图片分割准确度达 1%-7.5%,同时获得压缩了的深度学习模型。该研究已被 CVPR 2018 接收。

  论文下载地址:

  医疗影像在当今医疗诊断中发挥重要作用

  。其中,旨在获取组织器官以及相关生物结构的影像分割是医疗影像中重要的步骤之一,是进行疾病诊断、手术规划、治疗方案设计等的有力支持。传统的影像分割主要由病理专家进行手动分割,该过程单调且费时。然而,随着当前医疗影像的进一步普及,医疗影像无论在数量还是在种类上都急剧增加,传统的手动分割无法有效的处理大量多种类医疗影像。自动化医疗影像分割应运而生,但也面临着两大挑战:生物结构本身的多样性,以及医疗影像技术本身缺陷导致的低对比度和噪声等问题。

  当前深度神经络已经在医疗影像分割中展现出远超传统方法的准确度。Unet [1], DCAN [2,3], suggestive annotation [4] 等在多个医疗影像数据集上获得了令人惊喜的准确度提升。这些神经络或是通过改变神经络结构 [1], 或是改变训练中的目标函数 [2,3],或是优化选取的训练数据集 [4],来减少神经络本身的过拟合。与此同时,络量化被广泛用于对神经络进行压缩,以减少参数数量和运算量。作者发现在某些情况下 [5, 6],络量化也可以提升络的分类精度,具有减少络过拟合的潜能。因此,针对医疗影像分割问题,作者利用量化减少深度神经络的过拟合,进而提升其准确度。

  该论文的工作是基于已有工作 [4] 完成的。整个训练框架如图 1 所示。整个训练分成两步:提取训练集(QSA)和络训练(QNT)[4]。针对这两步,作者利用络量化来减少过拟合。在提取训练集中,通过选取合适的量化方法,提升训练出来的多个络(FCN)的异化程度,使得选取出来的训练集本身具有更高的代表性(representative)(如图 2 所示)。在络训练中,作者利用量化,减少过拟合,进一步提升络准确度。

  图 1 量化训练框架

  图 2 量化可以获取更高的络异化,进而获取更具代表性的数据集

  作者针对 Gland 数据集 [7] 对该方法进行了大量实验。通过对不同的量化方法进行对比,作者发现合适的量化往往可以获得的准确度,如图 3 所示——不量化会引起过拟合,而量化程度过高会引起欠拟合。如表 1 所示,与已有的工作对比,该工作可以获得的准确度。在六项比较中,该工作获得五项,一项第二的优异性能。

  图 3 不同量化方法的准确度差异:合适的量化会得到的准确度

  表 1 与已有工作的比较

  [1] O. Ronneberger, P. Fischer, and T. Brox. U-net: Convolutional networks for biomedical image segmentation. In Inernational Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, pages 234–241. Springer, 2015.

  [2] H. Chen, X. Qi, J.-Z. Cheng, P.-A. Heng, et al. Deep contextual networks for neuronal structure segmentation. In AAAI, pages 1167–1173, 2016.

  [3] H. Chen, X. Qi, L. Yu, and P.-A. Heng. Dcan: Deep contouraware networks for accurate gland segmentation. In Proceedings of the IEEE conference on Computer Vision and Pattern Recognition, pages 2487–2496, 2016.

  [4] L. Yang, Y. Zhang, J. Chen, S. Zhang, and D. Z. Chen. Suggestive annotation: A deep active learning framework for biomedical image segmentation. arXiv preprint arXiv:1706.04737, 2017.

  [5] S. Han, H. Mao, and W. J. Dally. Deep compression: Compressing deep neural networks with pruning, trainedquantization and huffman coding. arXiv preprint arXiv:1510.00149, 2015.

  [6] A. Zhou, A. Yao, Y. Guo, L. Xu, and Y. Chen. Incremental network quantization: Towards lossless cnns with lowprecision weights. arXiv preprint arXiv:1702.03044, 2017.

  [7] K. Sirinukunwattana, J. P. Pluim, H. Chen, X. Qi, P.-A. Heng, Y. B. Guo, L. Y. Wang, B. J. Matuszewski, E. Bruni, U. Sanchez, et al. Gland segmentation in colon histology images: The glas challenge contest. Medical image analysis, 35:489–502, 2017.

  [8] Y. Xu, Y. Li, M. Liu, Y. Wang, M. Lai, I. Eric, and C. Chang. Gland instance segmentation by deep multichannel side supervision. In International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, pages 496–504. Springer, 2016.

  [9] Y. Xu, Y. Li, Y. Wang, M. Liu, Y. Fan, M. Lai, and E. Chang. Gland instance segmentation using deep multichannel neural networks. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2017.

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